Мечеть в селе Верхний Кунакбай построена в 1849 году. После революции был разрушен минарет и мечеть была преобразована в школу, затем в клуб. В дальнейшем здание использовалось как столовая для колхозников. В 1990-е годы здание начало рушиться. В 2010 году было принято решение разобрать старое здание мечети и построить новое.
